1、抗藥菌株產(chǎn)生：使用抗生素時(shí)間長(zhǎng)，或療程短、頻繁更換品種以及用量不足等，可使病菌對(duì)藥物的敏感性降低，而產(chǎn)生耐藥菌株。耐藥菌株可使多種抗菌藥物療效降低或失效。

2、雞體抗病能力降低：飼料或飲水中長(zhǎng)期添加抗菌藥物會(huì)使雞的自身免疫功能下降，一旦藥物劑量不足或停藥，則更易受病原微生物的侵襲而發(fā)生疾病。

3、雞體中毒：超劑量用藥、累加用藥、多種藥物聯(lián)合使用以及長(zhǎng)期用藥等，均可造成雞體中毒和腸道正常菌群失調(diào)，而致消化不良、腹瀉生長(zhǎng)緩慢，嚴(yán)重者造成大批死亡。

4、藥物殘留與環(huán)境污染；長(zhǎng)期大劑量、不加限制地使用抗菌藥物，致使畜產(chǎn)品（尤其是肉食品）藥物殘留嚴(yán)重超標(biāo)，危害人的健康。一些不被腸道吸收的藥物，隨糞便排出而造成環(huán)境污染。