很多菜農習慣采取控水蹲苗的方法預防辣椒旺長，這樣雖能控制旺長，但往往由于水分供應不足，導致辣椒葉片功能下降，葉色黑綠，受害嚴重時植株萎蔫，影響辣椒生長。辣椒控水蹲苗應有度。

辣椒根系較弱，過旱或過澇都會影響生長，導致辣椒生長不良。如果為了防止旺長，而長時間不澆水，會導致土壤中的養分不能溶解，辣椒不能吸收肥水，生長弱小，開花坐果能力降低。尤其是到生長中后期，由于根系發育不良，辣椒進入坐果旺季會因根系吸收養分不足而大量落花落果，嚴重影響辣椒產量。

控制辣椒旺長，可以通過多項措施，如拉大晝夜溫差、早留果、增加留果量、使用激素等，不能過度控水，相反應通過合理澆水培育壯棵，促進辣椒根群擴展，提高產量。