黃瓜種子上帶有枯萎病、炭疽病、立枯病、角斑病等病原菌，因此在催芽前應該先對黃瓜種子進行表面消毒。主要方法有以下三種。

溫湯浸種：將干種子投入55℃～60℃溫水中處理約10分鐘，處理過程要不斷攪拌，之后再降溫到28℃～30℃浸種4～6小時，淘洗干凈后進行催芽。

藥劑消毒法：用有效成分0.1%的多菌靈鹽酸液浸種1小時，用清水沖洗后再用清水浸種4小時，即可浸種催芽。

種膜劑處理：有些黃瓜種子在出售時已經(jīng)由制種單位用含殺菌劑和多種微量元素的種膜進行了處理，用種膜劑處理有良好的殺菌效果。經(jīng)處理的種子可直接浸種催芽，也可直播。

種子經(jīng)消毒處理后，撈出清洗一遍，去水甩干，用布包好，置于27℃～30℃下催芽，催芽過程中要常翻動種子，使種子承受溫度均勻，經(jīng)24小時左右便開始出芽，種子露出根尖時，溫度可適當降低，維持22℃～26℃，經(jīng)兩天左右可以出齊。如在發(fā)芽后恰遇陰天不能播種，則可用濕毛巾將種子包好放在冷涼處10℃左右，抑制幼芽繼續(xù)生長，這種做法叫“蹲芽”。