導致棉花早衰的原因有：因病導致的早衰棉花病害以黃枯萎病危害最普遍、最重。發病與溫度關系密切，枯萎病在苗期地溫20℃左右時開始出現病狀，25℃~30℃時病情受抑制。黃萎病發病溫度較枯萎病高，所以發病高峰較枯萎病晚，氣溫25℃時發病率高，28℃以上時病情緩解，這一時期，如果降雨多，田間濕度大，病情將迅速蔓延。一般每年7~8月份發生普遍。
   營養失衡導致的早衰隨著機械化程度的提高和農村耕作習慣的改變，“衛生田”大量出現，忽視有機肥，只靠施用化肥，從而導致土壤營養失衡，土地后勁不足，抗災能力明顯下降。
   生育期載負過重導致的早衰棉花開花現蕾以后，營養生長與生殖生長并進。結鈴過多，導致生理負荷重，營養跟不上，植株抗性降低。而這一時期又正是黃枯萎病高發期。從而導致早衰。
   耕作栽培導致的早衰由于產棉區大面積種植棉花，導致輪作困難，重茬現象嚴重。在地勢低、排水不良的地塊，棉花根系發育不良，抗生菌數量較少，病菌積累嚴重，從而導致早衰。
   防治棉花早衰要從以下幾個方面入手：選用抗病品種選種時要選用經有關機構審定的多抗品種，嚴禁從重病區調入未經檢疫合格的種子，種子最好要脫絨包衣處理。
   合理輪作與深耕棉花最喜生茬種植。間隔4~5年內未種植過棉花的田塊，可通過深耕，改善土壤結構，促進植株健壯生長，防治早衰。
   加強田間管理棉田采用間歇式灌溉是最佳灌溉方式，這樣可以增強土壤透氣性，改善根際環境，這樣有利于微生物、抗生菌生長。灌溉以后，土壤易板結，這時要結合中耕培土。種植前最好把有機肥施足，生長期間補充化肥。一般增施磷鉀肥，穩施氮肥。前期氮肥施用過大，容易導致旺長和坐桃不穩。由于磷在土壤中流動性差，加之利用率低下，因此，磷肥施用對防治棉花早衰也極其重要，如果底肥施用磷酸二銨，那么棉花整個生育期狀況將明顯改善。含腐殖酸的化肥種植、追施時也應優先選擇。另外，加施硼鋅、微肥，中后期葉面噴施磷酸二氫鉀，對防治棉花早衰，都有很好的效果。
   藥劑調控對于病蟲害要適時防治，控制蔓延。發現病株及時處理。針對棉花的各個生育期要適時化學調控，使植株向著健壯、高產方向發展。