稻田施用丁草胺后，一般只有少量的藥物被稻苗吸收，而且在水稻體內會迅速分解代謝，稻苗對丁草胺有較大的耐藥力。但在用藥量過大的情況下，會對水稻幼苗造成藥害，出現生長受抑、根腫大等癥狀，嚴重的會導致死苗。一般認為，在移栽稻田和直播稻田使用丁草胺，60％丁草胺每畝用量不得超過150毫升，直播稻田用藥后田面不能有積水，移栽田用藥后水不能淹秧心。

在土壤偏旱的情況下，丁草胺的藥效發揮會受到影響。張飛高反映去年當地有農民在旱直播田按每畝用50%丁草胺乳油300毫升的劑量施藥后對直播稻沒有造成藥害，可能是用藥后田間土壤持續偏干，藥效發揮不充分。如果大面積生產上按這一劑量施用丁草胺，萬一在施藥后遇到大雨天氣，丁草胺藥效得以發揮，則很可能對水稻產生藥害。去年，丹陽等地就有讀者來電話反映，在直播稻田超量施用丁草胺后遇雨，水稻幼苗生長嚴重受抑，部分地段出現死苗等現象。直播稻播種季節緊，萬一發生藥害，補救的機動性很小，應盡可能避免藥害發生。

有研究表明，由于稻田長期施用丁草胺，千金子、稗草等稻田惡性雜草已對丁草胺產生了較強的抗藥性或耐藥性，直播稻田單用丁草胺很難達到理想的雜草防除效果。特別是在千金子等雜草較多的田塊，單用丁草胺后田間千金子仍可能大發生，以后不得不使用價格高的千金乳油等除草劑，反而會使防治成本增加。

在旱直播稻田，使用丁草胺與惡草酮的復配劑，或者施用丙草胺、施田補等除草劑，對千金子、稗草等雜草的防效更好些。