水稻條紋葉枯病的主要癥狀是：田間早期發病株先是在心葉上出現黃色條紋，葉片呈紙捻狀下垂，然后枯死，形成所謂的“假枯心”。“假枯心”苗與蟲害造成的真枯心苗相似，但無蛀孔、無蟲糞、不易拔起。不同水稻品種癥狀表現不一。糯稻、粳稻和高稈秈稻品種心葉黃白、柔軟、卷曲下垂，呈枯心狀；矮稈秈稻品種沒有枯心癥狀，心葉上出現黃綠相間的條紋，分蘗減少，病株提早枯死。抗病品種發病較輕，一般只表現心葉褪綠或有黃色條點，很少整株黃化死苗，后期病株能部分恢復。較遲發病的植株除葉片上有黃色條紋外，還有葉片發紅的現象。本田期發病植株明顯矮縮，葉片逐漸枯黃，發病重的整株枯死，不能抽穗；發病輕的生長受阻，雖能抽穗，但穗小而且畸形。水稻條紋葉枯病田間發病區域分布比較均勻。