采用農業防治與儲藏期管理相結合的防腐技術，可以使甘薯儲藏3～5個月的腐爛率由傳統方法的50％下降為10％。

　　綜合防治病害 甘薯病害主要有黑斑病、根腐病、莖線蟲病、軟腐病等，需采取綜合措施防治。（1）選用無病種薯。（2）重病田可與花生、玉米、水稻輪作。（3）培育壯苗，適當早栽，增施磷肥和腐熟有機肥，提高植株抗病能力。（4）適時收獲。一般氣溫下降至15℃時開始收獲，氣溫下降至12℃時入窖結束。氣溫降至9℃時薯塊會受冷害，儲藏期間易感病。選晴天上午收獲，在田間晾曬2～3小時，下午入窖。要求輕刨、輕裝、輕運、輕放，減少損傷。

　　嚴格對薯窖消毒 收獲前半個月選擇地勢高、土質硬、地下水位低的地方建窖，窖深4.5～5米，窖膛土層厚2.5～3米。最好用新窖，如用舊窖，需將窖壁及窖底土層刮去3～4厘米，露出新土，并在窖底撒一層細沙，然后用硫磺熏蒸1～2天，通常每立方米用硫磺50克。

　　加強儲藏期管理 入窖薯塊宜為紡錘形或卵圓形的短薯塊，薯塊重200～800克，要求無病蟲、無裂縫、無傷口、無露頭青、無凍害、無水浸。為防止儲藏期發生黑斑病、軟腐病等病害，可用70％甲基硫菌靈可濕性粉劑或50％多菌靈膠懸劑800倍液潑澆薯塊消毒。分類入窖，將薯塊裝入尼龍繩網袋層層碼放。如散放入窖，薯堆四周應距離窖壁20厘米以上。薯堆底層鋪一層秸稈，中間也放置秸稈，以利于散濕通氣。鮮薯儲藏量占整個薯窖的70％為宜。