藥物防治是漁業病害控制的主要措施，也是目前水產動物病害防治中最直接、最有效的方式。

    準確診斷 （1）養殖背景調查。池塘面積、水深、水源、養殖的品種結構、苗種來源、規格大小、放養密度等；檢測水體透明度、水溫、pH值等常規水質指標；飼料種類、水源、投餌方法、投餌量等；了解發病過程、已采取的防治措施、藥物使用情況等。（2）樣品采樣。收集瀕死、癥狀典型的病料作診斷樣本，采取冷藏方式運回實驗室作進一步檢測，如需進行組織病理切片等宜在現場對樣品進行分解、固定。（3）必要時應進行實驗室病原檢測，準確診斷病情。

    藥物選擇  （1）消毒劑。常用的主要包括生石灰、含氯消毒劑（如漂白粉、三氯異氰尿酸、二氧化氯等）、含溴消毒劑（如溴氯海因、二溴海因等）和含碘消毒劑（如聚維酮碘、雙鏈季銨鹽絡合碘）等。另外，醛類消毒劑（如甲醛、戊二醛等）、酚類消毒劑也有一定的作用。（2）驅殺蟲類。包括有機磷類、擬除蟲菊酯類、咪唑類、重金屬類以及某些氧化劑等。（3）水質（底質）改良類。主要包括一些化學物質（如沸石、過氧化鈣等）以及微生態制劑，如乳酸菌、芽孢桿菌、光合細菌硝化細菌、反硝化細菌、EM菌等。（4）抗菌類。主要有天然抗生素（如土霉素、慶大霉素等）、半合成抗生素（如氨芐西林、利福平等）以及人工合成的抗菌藥（如喹諾酮類、磺胺類藥物等）.（5）中藥類。常用的有大黃、黃柏、黃苓、黃連、板藍根、大蒜、鐵莧菜、水辣蓼、五倍子、菖蒲等，可作疾病預防用。

    給藥途徑  （1）口服法。常用于水產動物體內病原生物的消除、感染的控制、免疫刺激、體內代謝環境改善等。施用時應考慮同池其他混養品種。（2）藥浴法。藥浴法有全池遍灑和浸洗法兩種。遍灑法一般用于池塘水體。浸洗法用藥量少，可人為控制，主要在運輸苗種或苗種投放之前實施。（3）注射法。注射法用藥量準確、吸收快、療效高（藥物注射）,預防（疫苗、菌苗注射）效果好等，但操作麻煩，容易損傷魚體，藥物應現配現用。（4）涂抹法。具有用藥少、安全、副作用小等優點，但適應范圍較小。（5）懸掛法。具有用藥量少、成本低、簡便和毒副作用小等優點，常用于疾病預防。為保證用藥效果，用藥前應停喂1-2天，促使魚蝦進入藥物懸掛區去攝食。

    給藥劑量  （1）外用給藥量的確定。根據水產動物對某種藥物的安全濃度、藥物對病原體的致死濃度確定藥物的使用濃度。（2）內服藥給藥量的確定。根據魚的總體重和每日投餌量確定給藥量。

    給藥時間  一般選擇在晴天上午9-11時或下午3-5時給藥，避免高溫用藥，陰雨、悶熱天氣、魚蝦浮頭時不得給藥。

    用藥療程    療程長短應視病情的輕重、漁藥作用及其在體內的代謝過程而定。內服漁藥的療程一般4-6天，池塘潑灑藥物時，如需連續用藥，一般間隔1天施用1次。

    另外，養殖者應加強對漁藥使用休藥期意識，避免用藥后短時間內將養殖品種上市出售。