梅雨期雨水多、雨量大，生姜易發生根腐病。發病初期，下部葉片的尖端及葉緣變黃，后蔓延至整個葉片，并逐漸向上部葉片發展，直至整株黃化萎蔫枯死。病株莖基部呈水浸狀腐爛，刨根檢查地下塊莖褐變，根系不發達。該病與姜瘟的最大區別在于從莖基部外圍開始發病，種姜未見肉色壞死、不腐爛、無臭味。

該病屬真菌性病害（姜瘟是細菌性病害），以土傳為主，姜塊定植后溫濕度變化大、遇連陰雨天氣或水淹易發病，重茬、偏施氮肥、地勢低洼、雜草多的田塊發病重。

生姜根腐病屬土傳病害，發病后葉面噴霧效果差，宜采用拌土、灌根等方法施藥。發病初期可用可殺得三千46.1%氫氧化銅水分散粒劑500～1000倍液或75%百菌清可濕性粉劑1000倍液對病株灌根，每株灌藥液100～150毫升，每隔10天灌一次，連灌2次。可殺得三千46.1%氫氧化銅水分散粒劑為銅制劑，不可隨意與農藥、化肥混用，以防發生藥害。

預防生姜根腐病應注意以下幾點。（1）選用無病蟲、無霉爛的種姜，播種時每100公斤種姜用50%多菌靈可濕性粉劑200克加水100公斤浸泡，4～5分鐘后晾干待播。（2）發病嚴重的田塊，在整地時每畝用70%甲基硫菌靈可濕性粉劑或50%多菌靈可濕性粉劑或50%敵磺鈉可濕性粉劑1～1.5公斤，拌細土30公斤撒施。酸性土壤施石灰消毒，可預防土傳病害。（3）與禾本科作物實行2年以上輪作。（4）生姜喜透氣性好的土壤，可每畝基施腐熟土雜肥2500公斤、硼砂1公斤、硫酸鋅1.5公斤，改良土壤。