立枯病　在春季種子出苗前用70%敵克松500倍液噴灑床面；出苗后用50%多菌靈500倍液進行防治。

菌核病　此病多發生在6-7月，發病初期在葉柄基部，呈褐色條形病斑，擴展后地上部倒伏枯死。同時。病菌向根部蔓延。使根莖上布滿黑色菌核。以至全根腐爛僅剩根皮。其防治方法是：早春及時松土，提高地溫，注意排水；發現病株及時拔除毀掉；用0.3度石硫合劑、代森銨600-800倍液，代森鋅600倍液噴灑；適時采收，換地栽培。

銹病　干旱時應及時澆水，展葉后噴施50%多菌靈300倍液，7-10天1次，噴施2-3次。

蟲害　危害細辛的蟲害有小地老虎、細辛鳳蝶的幼蟲、黑毛蟲及蝗蟲、螞蟻等，它們咬食細辛的芽苞和葉片，可用敵敵畏、敵百蟲、速滅殺丁等藥劑防治。