將細胞內的酶與底物相互作用， 再將酶反應的產物作為反應物質，在酶的作用部位進行捕捉，使其在顯微鏡下具有可見性。這種在酶作用下產生反應產物， 經捕捉反應來間接證明酶定位的反應稱為酶的細胞化學反應。

酶的細胞化學反應包括兩個反應: 第一反應是酶作用于底物的反應， 稱酶反應，形成的產物稱為初級反應產物;第二反應是捕捉劑與初級反應產物的作用，稱捕捉反應，產生最終反應產物：

┌─────────酶的細胞化學反應─────────┐
　　│　　　　 酶＋條件 　　　初級　　　　 捕捉劑　　　　 │
　　底物─────────→ 反應產物 ───────→ 最終反應產物
　　　　　　　（酶反應）　　　　　　　　 （捕捉反應）