利用物理、化學等方法殺死病原微生物以防止傳染病傳播的措施。常用的消毒法有物理的加熱消毒法和化學的藥劑消毒法。加熱能使病原微生物細胞中的蛋白質凝固并使酶失活，因而能殺死微生物。煮沸是最常用的加熱消毒法，一般不產芽孢的微生物經5分鐘煮沸就可被殺死。用于消毒的化學藥劑稱消毒劑。常用的消毒劑種類很多，有75%酒精、碘酒、紅溴汞（紅藥水）、龍膽紫（紫藥水）、氯等。大多數消毒劑能使蛋白質凝固，碘酒中的碘能與蛋白質中的氨基酸結合，紅溴汞中的汞能與蛋白質中的巰基結合，氯在與水作用時放出具有很強氧化能力的新生氧，使蛋白質氧化變性。消毒劑一般只對細菌的營養體有效，而對芽孢很少有殺死作用。
　　消毒在日常生活中應用于傳染病的預防，如對飲水、食品、餐具等通過煮沸進行消毒。牛奶、飲料等食品可放在62～63℃下處理30分鐘進行消毒。這樣既可將結核分枝桿菌、傷寒沙門氏菌等病原微生物殺死，又不影響牛奶、飲料等的風味。英國醫生李斯特于1865年首先使用石炭酸對醫生的雙手、手術器械、包扎繃帶、手術部位等進行消毒，其后外科手術的死亡率很快從45～80%下降為15%。這充分顯示了消毒在臨床應用上的重要作用和意義。