病毒病：病毒病能通過種薯傳播，是馬鈴薯品種退化的主要原因。病毒為害主要有兩種：一是皺縮花葉；二是卷葉。防治方法：選用抗病品種及進行脫毒處理。選用無病毒種薯，田間作業時，注意盡量減少人為傳播，及時噴藥防治蚜蟲，可用40％樂果乳劑800~1000倍液噴殺。 
    晚疫病：又稱馬鈴薯瘟，是生產上的主要病害。病菌可浸染葉片、莖及薯塊。葉片多從尖端或葉緣開始發病。病斑黑褐色，水漬狀，邊緣不明顯，潮濕時，葉背病斑邊緣上生一圈白霉，嚴重時植株一片焦黑，發出特殊的腐敗臭味。防治方法：選用抗病品種及無病種薯，種植前進行種薯消毒，藥劑（福爾馬林）、溫湯消毒均可。及時拔去中心病株和進行中耕除草。 　 
    在當地發病前開始噴波爾多液預防。或用80％代森鋅600~800倍液、75％百菌清600~800倍液防治。 
    環腐病一般在開花期前后開始表現癥狀，病株枝，莖縮短，葉色褪黃凋萎，葉脈間變黃，產生黑褐色斑塊，葉緣略向上卷曲。防治方法：選用無病種薯，留種和切薯前徹底淘汰病薯，切塊時要注意刀的消毒。發現病株時及時消除。注意防治地下害蟲，實行輪作，選用抗病品種。 　 
    瘡痂病：瘡痂病菌是一種線菌，只侵害薯塊。發病初期在薯塊上產生褐色圓形或不規則小點，表面粗糙，呈瘡痂狀硬斑，一般只在薯塊皮部發病。溫度高時發病較重。防治方法同環腐病。