化肥與農家肥配施效果要好于單獨施用化肥或農家肥，但施用時應注意以下幾點：
施用時間農家肥見效慢，應早施，一般在播前一次性底施；而化肥用量少，見效快，一般應在作物吸收營養高峰期前7天左右施入。
施用方法農家肥要結合深耕施入土壤耕層，或結合起壟扣入壟底。與農家肥搭配的氮素化肥，30%作底肥，70%作追肥。磷肥和鉀肥作底肥一次性施入。
施用數量化肥與農家肥配合施用，其用量可根據作物和土壤肥力不同而有所區別，如在瘠薄的地上種玉米，每畝可施農家肥4立方米、尿素24公斤、磷肥13公斤，或施15：15：15復合肥13公斤。中等肥力的土壤可施農家肥3立方米、尿素20公斤，或施15：5：15的復合肥12公斤。高肥力土壤可施農家肥2.5立方米、尿素15公斤。尿素在追肥時使用效果更佳。復合肥以底肥為佳。