掃描電鏡在觀察生物樣品時，具有以下特點：
（1）多角度觀察樣品的表面結(jié)構(gòu)；
（2）不需要將樣品切成薄片；
（3）景深大、圖像立體感強；
（4）放大倍數(shù)從幾十倍到幾十萬倍連續(xù)可調(diào)；
在觀察形貌的同時可以對微區(qū)的成分進行定量和定性分析。而能否獲得真實、清晰、理想的掃描電鏡觀察結(jié)果，樣品的制備過程是關(guān)鍵。
生物樣品含水直接觀察，會對掃描電鏡造成以下影響：
1.  樣品蒸發(fā)的水蒸氣遭遇高能電子束，會被電離而放電，引起束流大幅度波動，使圖像模糊，或者根本不能成像;
2.  大多數(shù)含水樣品在高真空中容易發(fā)生形態(tài)損傷，表面皺縮、變形; 
3.  樣品揮發(fā)會造成鏡頭、光闌等的污染; 
4.  燈絲會被上升水蒸氣氧化而變質(zhì)。
生物樣品的含水量高，二次電子產(chǎn)率低，導(dǎo)電性差，對熱，電子束敏感，僅有少數(shù)樣品如毛發(fā)、牙齒以及含水量極低的昆蟲等可以直接噴鍍觀察，絕大多數(shù)的生物樣品均要求經(jīng)過干燥處理才能鍍金觀察。
干燥是掃描電鏡生物樣品制備中的關(guān)鍵環(huán)節(jié)，如果處理不好，會直接影響到觀察的清晰度與準確度。要想制備出好的掃描電鏡生物樣品，需要在干燥過程中盡可能減少由于水分蒸發(fā)而引起的樣品表面形貌的形變，且必須確保干燥。大多數(shù)動植物容易發(fā)生明顯的塌陷和變形。因此，需要針對不同的生物樣品來選擇合適的干燥方法。