藥用昆蟲在采收后貯藏備用的過程中，發生害蟲蛀食時，如進行藥劑或物理機械防治，不但會破壞藥物成分，改變藥理功能，而且直接煎熬或外用都會對人的身體健康不利。
　　保護昆蟲藥材不遭蟲害的最佳選擇，應以防重于治為上策，把重點放在“管”字上。
　　1、加強檢疫。嚴格遵守《檢疫法》，如發現檢疫對象的危險性害蟲，應及時采取對策，就地消滅。
　　2、“防患于未然”是管理昆蟲藥材的最佳決策。只要做到干、凈、嚴三方面，不但可防止蟲蛀，還可防止霉爛變質，充分發揮其治病功能。
　　①干。除指定使用漿液的昆蟲藥材及其制品外，貯存前應使其充分干燥。因蛀食性害蟲的發生、繁殖都需要一定的濕度，干燥的環境則減少其生活及棲息源地，從而起到防蛀作用。
　　②凈。采收后的昆蟲藥材，在晾、曬過程中必須撿出雜物、污物。有些害蟲屬喜土壤、糞便的種類，藥材貯藏前應用常溫清水洗凈，充分晾干后再收藏。一般倉庫害蟲的共性是喜污物、異味、雜亂的處所，只要藥材本身潔凈，則很少招來蟲害。
　　③嚴。有些含脂肪多，表皮層較薄的易受蟲害的昆蟲藥材，應保存在容器中，容器的口要封嚴防濕，并放在清潔、溫濕度變化小的地方保存，經常檢查，可防蟲、防霉變。