大豆油在貯藏中，容易受油脂本身所含水分、雜質及環境空氣、光線、溫度等因素的影響而酸敗變質。因此，貯藏大豆油必須盡量減少其中的水分和雜質含量，貯藏在密封的容器中，放置在避光、低溫的場所。通常的做法是，油品入庫或裝桶前，必須將裝具洗凈擦干，同時認真檢驗油品水、雜含量和酸價高低，符合安全貯藏要求的方可裝桶入庫。大豆油中水分、雜質含量均不得超過0.2 %,酸價不得超過4.桶裝油品不宜過多過少。裝好后，應在桶蓋下墊以橡皮圈或麻絲，將桶蓋擰緊，防止雨水和空氣侵入。同時每個桶上要及時注明油品名稱、等級、皮重、凈重及裝桶日期等，

    以便分類貯存和推陳貯新。桶裝油品以堆放倉內為宜，如需露天堆放，桶底要墊以木塊，使之斜立，桶口平列，防止桶底生銹和雨水從桶口浸入；高溫季節要搭棚遮蔭，以防受熱酸敗；嚴冬季節在氣溫低的地區，無論露天或庫內貯藏，都要用稻草、谷殼等圍墊油桶，加強保溫，防止油品凝固。