魚種消毒法大水面養魚必須在投放魚種季節選擇體格健壯的大規格魚種，經過藥物消毒后方可投放。常用藥物有漂白粉、魚用敵百蟲、食鹽、亞甲基藍等，這些藥物對魚體表和鰓部的細菌、寄生蟲都有一定的殺滅作用。

    餌料消毒法 病原體往往隨餌料被帶入魚體，所以投喂的餌料必須清潔、新鮮，最好能經過消毒處理。動物性餌料如螺、蜆等要用清水洗凈，選取鮮活的個體投喂。植物性餌料如水草、陸草，則應放在6×10-6的漂白粉溶液中浸泡20～30分鐘再投喂。施用有機肥培育天然餌料時，應在每1000公斤糞肥中加漂白粉200克，攪拌均勻后再投入水中。

    藥物掛袋法 藥物掛袋必須先設置好固定食臺，使魚養成定位吃食的習慣。要定期用藥物掛袋（一般每隔20～30天用一個療程），用漂白粉掛袋，每袋裝100克，每天換1次，連續3天；用硫酸銅、硫酸亞鐵掛袋，每袋裝硫酸銅100克、硫酸亞鐵40克，每天換1次，連續3天。藥袋應掛在食臺周圍，每個食臺可掛3～6個袋。

    投喂藥餌法 大水面生長的草魚、青魚容易患腸炎病，在發病季節（每年5～10月）用二氟沙星進行預防，第一天第一次按吃食魚體重每10公斤用二氟沙星藥粉1克計算，以后每次投量減半，用次面粉等做成黏合劑制成藥餌投喂。另外，用大蒜拌草或用食鹽浸草喂草魚，預防傳染性疾病效果較好。

    中草藥防治法 中草藥可就地采集。馬尾松葉可防治草魚腸炎病和爛鰓病；烏桕葉、大黃根和莖可防治魚爛鰓病、白頭白嘴病；地錦草、鐵莧菜可防治草魚、青魚腸炎病和爛鰓病；楝樹根、莖、葉可防治魚寄生蟲病；土荊芥、貫眾可防治魚毛細線蟲病。中草藥的根、莖、葉腐爛后又可肥水。

    控制施肥法大水面養魚必須控制人工施肥的數量，過量施用人畜糞，魚容易感染寄生蟲病；過量施用化肥，浮游生物會突然大量繁殖，高溫期間容易導致暴發性魚病的發生。