在低溫情況下（8℃~20℃），草魚的新陳代謝能力較弱，通過接種途徑可使二齡草魚獲得新的免疫抗原劑量，經過5~30天的低溫（10℃~15℃）誘導，接種過疫苗的草魚魚種完成初次免疫，待水溫在20℃以上時草魚的免疫抗病水平得到迅速加強，從而達到減少二齡草魚發病機會的目的。

時間選擇 接種疫苗宜選擇在水溫8℃~22℃的春季進行，以利于水霉病的預防。患病的草魚不宜接種疫苗。

魚種準備 規格在8.3厘米以上的各種健壯無病的草魚魚種均可實行免疫接種，接種前用0.5%的食鹽水對魚種進行消毒處理，時間控制在5~10分鐘。為了便于生產操作，可用敵百蟲水溶液對魚種進行麻醉處理。

工具選擇 接種器、針頭以及稀釋器皿須用75%的酒精消毒或用開水煮沸消毒。規格在10厘米以下的魚種一般選用4.5號或5號接種針頭，規格在10~16.7厘米的魚種一般選用5.5號或6號接種針頭，規格在16.7厘米以上的魚種一般選用7號接種針頭。為了防止接種時入針太深傷及魚體內臟，可在接種針頭上套一小截塑料管，使暴露出的針尖長度略長于魚體腹肌厚度。

疫苗稀釋 在使用前需先用0.65%的生理鹽水將濃縮液稀釋10倍，一瓶稀釋好的疫苗盡可能一次用完，如一次用不完，可用接種器抽取需要量使用，抽取后用醫用膠布封住瓶口針眼。

接種部位及劑量 在草魚的腹鰭基部接種，將針頭與魚體以45度角刺入魚體。規格在10厘米以下的魚種每尾接種0.5毫升稀釋后的疫苗，規格在10~16.7厘米的魚種每尾接種0.5~1毫升稀釋后的疫苗，規格在16.7厘米以上的魚種每尾接種1毫升稀釋后的疫苗。