目前，一般養殖戶大多采用漂白粉，高錳酸鉀、食鹽和抗生素等藥物消毒。采用此法，必須事先對龜苗進行檢查(包括混養的魚類)，然后根據不同的病源體，分別采用不同的藥物進行消毒處理。所以，難度大，要求高，稍有差錯就易產生副作用，一般養殖戶不易掌握。

浙江省海寧市龍頭閣兩棲爬行動物研究所經過多年的實踐，摸索出采用維生素C溶液對龜苗進行消毒。此項新方法，對龜苗的皮膚和皮膚膜既有保護作用，又有殺菌效果。因為，當維生素C與龜苗表皮和皮膚膜中的膠原蛋白質結合后有促進膠原組織如結締組織，皮膚等細胞間質的形成和功能，從而起到保護皮膚的作用。同時，維生素C是一種酸性物質(也叫抗壞血酸)，當酸度達到一定濃度時，就有殺菌消毒作用。所以，采用維生素C對龜苗消毒處理，不但方法簡單，而且效果好，成本低，便于廣大養殖戶掌握應用。

維生素C溶液消毒處理的操作要點是：用一只直徑1米的塑料大盆，裝8kg水，放入4g維生素C原粉，攪拌使其充分溶解后放入160只龜苗，浸泡10分鐘即可消毒殺菌，然后放養，養殖戶可根據自己龜苗數量，定量用藥，一般一盆藥水可用4次800只龜苗。