清整池塘是搞好健康養殖的重要一環，它包括清塘和整修兩方面工作。前者指排干池水，挖除過多的淤泥，讓池底充分日曬、冰凍或用生石灰、漂白粉等藥物全池潑灑以達到殺菌消毒、殺滅敵害生物之目的。后者指池塘加固、查修設施、疏通進排水口等，做好防逃、防滲、防漏工作。清整好處如下：

1、提高水體載魚量。目前部分池塘由于多年沒有清淤，池堤塌陷、底淤較多（有的深達０．６～０．７ｍ以上）、塘口變淺，水體空間相對降低，有的水深僅１．２ｍ左右,影響了水體載魚量。存在易浮頭、易發病、產量低等問題，制約著漁業經濟的發展。一旦提高畝放養量，夏季極易浮頭，易死魚。只有清除過多的底淤，拓寬生存空間，提高單位面積放養量，才能有效地提高經濟效益。

2、減少病害隱患。池塘淤泥層一般20厘米左右，較為適宜。它有供肥，保肥和調節水質肥度的作用；過多易惡化水質，易缺氧，易發病。底層淤泥多，其中有機質也多，大量的有機質氧化分解，消耗大量氧，往往使池塘下層中本來不多的氧消耗殆盡，造成缺氧狀態。在缺氧條件下，嫌氣性細菌又大量繁殖，其分解作用，產生很多有害物質如氨、硫化氫、甲烷、有機酸等，對魚類生長不利。再就淤泥過多，易使水質惡化，酸性增強，病菌易于大量繁殖，同時在不良環境中，魚體抵抗力減弱，易發生疾病。當天氣悶熱，突然降雷陣雨，或出現強對流天氣，溫度變化幅度大于３～５℃時，淤泥多的池塘易缺氧、泛塘、易暴發疾病。通過清淤，提供良好環境，可減少病害隱患。

3、改良底質，預防疾病。在清淤的同時，采取冰凍、日曬，或施生石灰法殺菌消毒，改良底質，預防疾病。排干池水，讓池底充分接受風吹日曬和冰凍，可殺死許多害蟲和細菌，促進淤泥中有機質的氧化分解，為改善水環境創造了條件。清塘藥物首選生石灰，劑量：75～120kg/畝（干法）。若不用生石灰，一般建議補施適量生石灰（２０ｋｇ左右／畝）加以改良。生石灰作用如下：⑴當PH=11時，能有效殺滅潛藏和繁殖生長在淤泥中的魚類寄生蟲、病原菌、對魚類有害的昆蟲及其幼蟲等。⑵可中和淤泥中的各種有機酸，使池水保持適宜的酸堿度。⑶提供鈣質，促進淤泥中被固定的營養鹽的釋放，增加池水肥度。⑷魚類生長需適宜的堿度、硬度，通過施生石灰，可提高水體的堿度和硬度，增強水體的緩沖能力。