面積較大的連片生產田由于土壤條件和管理措施存在差異，可能導致不同片區種子成熟期不一致，此時，應先收獲成熟較早的片區，減少成熟種子的落粒損失。

收獲時間要考慮收獲方式的差異。當使用作業效率較高聯合收割機收獲時，可在最佳收獲時期采收；而使用小型割草機或人工采收時，作業效率較低，應適當提前收獲時間。

收獲時間還需要兼顧氣象條件。降雨會降低種子質量，增加采收作業難度，應盡可能避免雨季收種。可根據天氣預報適當提前或推后收獲時間。

二、收獲方法

采收苜蓿種子一般可用聯合收割機、割草機或人工采收。

使用聯合收割機收獲時，可在收割前3～5天對植株噴灑干燥劑進行干燥處理。干燥劑為接觸性除銹劑，如敵草快、敵草隆、利谷隆等。采收應在無露無霧、晴朗干燥的時候進行，這樣種子易于脫粒，減少收獲損失。目前國內的聯合收割機大多數不是專業的牧草種子收獲機械，因此，收獲苜蓿種子時應對相關參數進行適當調整，降低采收過程中的損失。

三、種子干燥

剛收獲的種子必須立即進行干燥。應充分利用較好的天氣條件進行曝曬或攤晾，晾曬場地以水泥曬場為好。晾曬的種子應攤成波浪式，厚度不超過5厘米，并適時翻動。

如收獲后天氣潮濕，應使用專用的干燥設備進行人工干燥，如火力滾動烘干機、烘干塔、蒸汽干燥機等。烘干溫度保持在30℃～40℃。

四、種子清選

使用種子專業牧草種子清選機對干燥后的種子進行清選，要在盡可能減少凈種子損失的前提下，除去種子中的混雜物或其它植物種子。常用的清選方法有風篩清選、比重清選、窩眼清選和表面特征清選等。常用設備有氣流篩選機、比重清選機、窩眼盤分離器和螺旋分離機等。

五、收獲后的種子田管理

種子收獲后，應及時清除田間的稿稈。對于植株密度過大（大于25株/平方米）的種子田，應進行行內疏枝。行距60厘米時，每隔30厘米耕除行內30厘米長度范圍內的植株。

根據種子田的土壤養分狀況，適量施入磷肥、鉀肥等肥料。入冬前要灌足冬水。