近年來隨著化肥施用面積的不斷擴大，施肥不當問題逐漸顯露出來。為降低化肥投入成本，緩解化肥對環境的負面影響，對應措施之一就是拓寬肥料種類，采用科學施肥方法，以提高施肥效率。

廣辟綠色肥源，充分利用草類。一是水稻田的前茬要倡導恢復種植綠肥。二是旱地作物前茬，安排20-30%的豆類作物，旱地作物播種前翻耕作綠肥或在作物行間套種綠肥、豆類、花生等豆類作物。三是提倡在旱地作物行間蓋草，這樣可保溫保肥保水，減少表層土壤流失，同時可抑制雜草滋生，還能預防作物倒伏，改良土壤，增加肥效。

按照目標產量搞好平衡施肥。在一定的施肥水平范圍內，作物的產量與施肥量呈正相關系，過于增加施肥總量或者增加單一施肥數量，由于營養環境失去生態平衡，反而會遭致減產。因此，不能說肥料施用越多產量就會越高。據測定，每生產100公斤稻谷，需從土壤中吸收氮1.85公斤，五氧化二磷0.85公斤，氧化鉀2.1公斤。每生產100公斤皮棉，需吸收氮12公斤，五氧化二磷4公斤，氧化鉀12公斤。只有平衡施肥，才能防止肥料間的相克現象，防止盲目增加肥料投入，以便節省成本。

堅持深層施肥，做到以水調肥。撒施化肥，既易揮發污染空氣，又易流失污染水域。生產上要堅持化肥深層施用，以便用土壤覆蓋保護化肥，減少揮發和流失。在墑情不足時，要適量灌水調墑，做到以水調肥。如在蒸發量過大時，缺墑往往易導致液肥濃度增高，產生肥害，適墑釋放肥料才能使適量的肥料充分發揮肥料效應，減少消耗與浪費。

增施有機肥料，增強吸附能力。農家積造的廄肥、堆肥等有機肥料雖然釋放較慢，但養分比較齊全，吸附能力較強。將化肥與農家有機肥料混拌后，其中的速效養分可被有機肥料吸附或者相結合，爾后逐漸釋放出來，既延長了供肥時間，又減少了養分無謂的消耗。

改進肥料制劑，調控供肥高峰。一是將幾個單一品種肥料制成廣譜型的復合肥料。二是根據作物的需肥特點制成專用型肥料。三是運用改性手段將速效肥料制成緩釋肥料。四是將無機肥與生物有機肥配制成優勢互補的顆粒肥料，如合緣酵素菌生物有機復合肥等，可提早或推遲施用時間，使作物的需肥高峰與供肥高峰相符，充分發揮不同肥料的肥效。