鑲嵌進化 mosaic evolution 指進化中表現型的各個部分獨自地進行變化。最易看到的是菊石類的進化，但S． M．Stanley（1979）則更進一步地舉出了下述例子：（1）在人科的系統發生（進化）中，早期為了雙肢移動，特別是腰帶發生了變化，另外頭骨形狀和腦的大小也在其后發生了迅速的變化；（2）在象的系統發生中，Mam－muthus和Elephas系統，早期臼齒迅速變形，額部稍現短化；在Loxodonta系統中，最早期就發生了額部短化，但另一方面，臼齒變化卻很遲緩；（3）腹足類的Acteon和Architectonica，進化程度是介于其祖先前鰓類與其后代后鰓類之間，后鰓類的鰓及其雌雄同體性巳經定型，但其朝向前方的外套腔、厴、捩神經系統則表現為前鰓類的階段。鑲嵌進化，在系統發生中構造上發生急劇的變化，調節系統具有部分的主自性，說明機能與形態間的聯系是很明顯的。
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