雖然棉田積水后，植株仍能生長，但淹水時間過長，會嚴重影響根系活動，容易造成大量葉片和蕾鈴脫落，必須在可能的情況下及時排水，盡量減少田間積水時間。

2.及時扶苗、洗苗

棉花經過水淹和風吹，根系受到損傷，往往造成棉株倒伏，排水后必須及時扶正、培直，并洗去葉片及枝條上的淤泥，以利進行光合作用，促進植株生長。

3.及時中耕、培土

受澇棉田排水后土壤板結，通氣不良，水、氣、熱狀況嚴重失調，必須及早中耕，破除板結，并結合中耕進行培土，以提高植株根際的土壤溫度和防止倒伏。

4.及時增施肥料

棉田經過水淹，土壤養分大量流失，加上根系吸收能力衰弱，及時追肥對棉株恢復生長和增結秋桃十分有利。在棉株恢復生長前，以葉面噴肥為主；棉株恢復生長后，可在距棉株10~13厘米處，開溝(穴)追施碳銨10~15千克／畝或尿素5~7.5千克/畝。

5.及時防治病蟲害

受災棉株恢復生長后，枝葉幼嫩，前期蚜蟲多，后期易受棉鈴蟲、棉小造橋蟲等為害。因此，要早治、狠治，做到每葉必保，每蕾（鈴）必爭，最大限度地提高單株產量。同時，由于受澇棉田田間濕度大，容易引起爛鈴，要切實加強防治。另外，遭受澇災的棉花要適當推遲打頂時間（一般要比正常棉花晚打頂5~10天），遇秋旱及時澆水，后期適時進行人工催熟。