從棉花的收獲到第二年播種前，是棉花病蟲害的越冬期，在此期間棉花的病原菌和害蟲都在各種場所潛藏越冬和休眠。抓住越冬期的有利時機進行防治，可降低來年病蟲基數，收到事半功倍之效。

1、清潔田園。棉花紅鈴蟲、紅蜘蛛、蚜蟲、盲椿象、炭疽病菌、立枯病菌等，可在棉田遺留的枯枝、落葉、爛鈴以及雜草上越冬。徹底清除枯枝落葉爛鈴，鏟除田內及四周雜草，可有效地消滅越冬病蟲。清除物要及時集中燒毀或深埋，切忌堆積在田邊。

2、深耕灌水。棉鈴蟲、地老虎、斜紋夜盜蛾、造橋蟲等在土壤中越冬，可采用深耕灌水措施殺滅。此法防效顯著，棉鈴蟲的死亡率可達90％以上。深耕深度30－40厘米，把表土翻到下面，底土翻到上面，翻起的大土塊暫不打碎，以利冬凌風化。冬灌宜在三九天進行，要灌透灌勻。一般每畝灌水量為80－120立方米，粘土田應略多灌一些，方式以溝灌為好，忌大水漫灌。

3、藥劑熏蒸。炭疽病菌、角斑病菌、紅腐病和紅鈴蟲等多種病蟲，可附著在種子內外越冬。可將貯種倉庫密封，每立方米空間用溴化甲烷32－37克熏殺，密閉3天，可殺死棉種中98％的紅鈴蟲及部分病原菌。也可把棉種放在“三開一涼”的熱水中（水溫65度左右）攪拌浸泡，殺蟲殺菌效果也好。

4、消滅貯藏場所蟲源。棉花紅鈴蟲幼蟲主要躲在貯存棉花的倉庫四壁縫隙和收曬運貯工具的空隙中越冬，因此，可在貯存棉花前對倉庫內的墻壁用石灰漿噴刷，填平間隙，然后用50％敵敵畏乳劑100倍液，噴在墻上地面，再放棉花，封嚴門窗，毒殺紅鈴蟲。將收、曬、運貯時使用過的工具，用開水浸燙或用除蟲藥劑噴灑，消滅潛在的幼蟲。如在水中浸泡一周，則除蟲效果更佳。