1 親合雜交：在靶核酸存在下，兩個探針與靶雜交，形成夾心結構，雜交完成后，雜交物可移到新的管或凹孔中，在其中雜交物上的吸附探針可結合到固相支持物上，而雜交物上的檢測探針可產生檢測信號。用生物素標記吸附探針，用125I標記檢測探針，這個系統的敏感性可檢測出4×106靶分子。該試驗保持了固相夾心雜交的高度特異性。
　　2 采用多組合成探針和化學發光檢測：第一類探針是未標記的檢測探針和液相吸附探針，它們有50個堿基長，其中含有30個細菌特異序列堿基和20個堿基的單鏈長尾；第二類探針是固相吸附探針，它可吸附在小珠或微孔板上。未標記檢測探針的單鏈長尾用于結合擴增多個標記探針，液相吸附探針和靶雜交物從溶液中分離并固定在小珠或微板上，典型的試驗可用25個不同的檢測探針和10個不同的吸附探針。第一個標記檢測探針上附著很多酶（堿性磷酸酶或過氧化物酶）可實現未標記檢測探針的擴增。使用化學發光酶的底物比用顯色反應酶的底物更敏感。這個雜交方法已用于乙肝病毒、沙眼衣原體、淋球菌以及質粒抗性的檢測，敏感性達到能檢測5×104雙鏈DNA分子。