一般說來應用DNA芯片進行實驗包括5個過程：生物學問題的提出和芯片設計；樣品制備；生物雜交反應；結果探測；數據處理和建模。

1．樣品制備。一般所需mRNA的量是以一張表達譜芯片需要3μg mRNA計算的

不同組織抽提3－10μg mRNA所需組織量

考慮到個體差異以及樣品在研磨、勻漿等過程中的損失，客戶提供的樣品量應在上述基礎上增加1-2倍。

2 樣本采集過程關鍵點．

組織標本采集操作建議規程,(取標本所需關鍵器材和處理要求 )

注：
· 以下步驟1 － 5應在冰上進行且不超過15分鐘，超過時間會導致樣品的RNA降解。
· 對腫瘤組織的取材，要求盡可能準確地判定腫瘤和正常組織，例如對于手術切除的整個或部分前列腺，可能要根據冰凍切片報告的結果來判定要進行研究的取材部位。

1 離體新鮮組織，切成多個1cm3小塊，剔除結締組織和脂肪組織。胃、腸組織應剪除外膜；肝、腎、脾應剪除門部血管神經，腫瘤組織應將周圍的正常組織切除干凈（正常組織也應將周圍的腫瘤組織切除干凈）。

2在RNase-Free 0.9％生理鹽水中漂洗樣品，以去除血漬和污物。

3 用鋁箔包裹組織，或用5ml凍存管裝載組織(但最好統一采用鋁箔)。用記號筆在鋁箔或凍存管外表寫明樣品編號，并貼上標簽，迅速投入液氮冷卻。

4 填寫樣品登記表，寫明樣品名稱、種類、編號、取樣日期、樣品處理情況等

將液氮冷卻的組織放入樣品袋（每個樣品袋只保存同樣的組織），袋口留一根編號繩，繩上粘一張標簽紙（標簽上注明：樣品名稱、編號、日期），迅速轉入便攜式液氮罐

5 保留1-2張取材部位的病理切片。